在企业经营过程中，股权变更是一个常见的操作，尤其是在公司重组、股权转让或引入新股东等情况下。而在这个过程中，涉及的税务问题也日益受到关注，其中就包括股权变更所涉及的印花税。那么，股权变更印花税的计税依据怎么算？这是很多企业主和财务人员关心的问题。

首先，我们需要明确的是，印花税是一种行为税，主要针对经济活动中书立、领受、使用应税凭证的行为进行征税。而在股权变更中，通常涉及的是股权转让合同，这类合同属于印花税的应税凭证之一。

根据我国现行的税收政策，股权转让合同需要缴纳印花税，其计税依据为合同中约定的转让金额。也就是说，无论实际交易价格是否高于或低于市场价，只要合同中有明确的转让金额，就以此作为计税基础。

不过，需要注意的是，不同地区的税务机关可能会有不同的执行标准。有些地方会要求企业提供评估报告或审计报告，以确认转让价格的合理性，防止通过低价转让避税的情况发生。因此，在签订股权转让合同时，建议提前与当地税务局沟通，了解具体的操作流程和计税方式。

此外，还需要注意的是，印花税的税率通常是0.05%，即按照合同金额的万分之五来计算。例如，如果股权转让金额为1000万元，则需缴纳印花税为：1000万 × 0.05% = 5000元。

但也有例外情况，比如某些特殊类型的股权变更（如非货币性资产出资、内部股权转让等），可能适用不同的规定或优惠政策。因此，在实际操作中，建议咨询专业的税务顾问或会计师，以确保合规并合理规避风险。

总结一下，股权变更印花税的计税依据主要是股权转让合同中约定的金额，按0.05%的比例计算。但在实际操作中，还需结合当地政策和具体情况灵活处理，避免因理解偏差而导致税务风险。

如果你正在面临类似问题，建议尽早准备相关材料，做好税务筹划，确保整个股权变更过程合法、合规、高效。